Glavni cilj odjeljenja za međusektorku saradnju i reformu javne uprave je saradnja sa javnom administracijom, naročito sa Vladom i lokalnom samoupravom, kao i sa međunarodnim organizacijama i Evropskom Unijom. Kroz ovaj program doprinosimo transparentnosti u radu državnih organa, boljem položaju nevladinih organizacija kao i boljoj saradnji između vladinog i nevladinog sektora.

Saradnja sa Vladom se ogleda u sljedećem:

• Monitoring realizacije Strategije Vlade i NVO i implementacija pojedinih aktivnosti iz Akcionog plana Strategije koju je Vlada usvojila januara 2009. godine

• učestvovanje u izradi modela Programa i Akcionog plana za borbu protiv korupcije u lokalnoj samoupravi koji je Vlada usvojila jula 2008. godine

• Monitoring implementacije Uredbe o kriterijumima i načinu raspodjele dijela prihoda od igara na sreću koju je Vlada donijela juna 2008.

• učestvovanje u brojnim radnim grupama

• dostavljanje mišljenja, komentara i reagovanja na zakone, strateške dokumente ili aktivnosti koje preduzimaju vladina tijela i sl.

Fokus saradnje sa Skupštinom predstavljaju sljedeće oblasti:

• obezbjeđivanje sveobuhvatne baze podataka NVO i pojedinaca za poslanike u Skupštini

• povećanje učešća predstavnika NVO i pojedinaca u radu parlamentarnih odbora

• razvijanje i jačanje institucionalnih mehanizama saradnje na relaciji NVO- Skupština

• edukacija NVO o parlamentarnim procedurama

Saradnju sa lokalnom samoupravom oslikavaju sljedeća dostignuća:

• uspostavljanje institucionalnog oblika saradnje lokalnih samouprava i nevladinih organizacija u Crnoj Gori

• donošenje dokumenata koji regulišu odnos između NVO i lokalnih samouprava, a koji su predviđeni Zakonom- Statut opštine, Odluka o učešću stanovništva u vršenju javnih poslova, Odluka o kriterijumima, načinu i postupku raspodjele sredstava nevladinim organizacijama, Poslovnik o radu skupštine opštine, Odluka o savjetu za razvoj i zaštitu lokalne samouprave, Odluka o mjesnim zajednicama. 

• Učešće predstavnika NVO u lokalnim savjetima i radnim tijelima

• Jačanje instituta “prazna stolica” kojim se reguliše učešće predstavnika NVO na sjednici lokalnog Parlamenta, pri čemu NVO mogu intezivno učestvovati u diskusiji po tačkama dnevnog reda bez prava glasa

• Edukacija lokalnog stanovništva i NVO o mehanizmima participacije na lokalnom nivou

• Edukacija lokalnih službenika o uključivanju NVO u procese kreiranja odluka na lokalnom nivou

• Monitoring i realizacija lokalnih akcionih planova za borbu protiv korupcije